Было решено разделить будущую фабрику на пять больших управлений. Первое занималось переработкой руды и давало на выходе продукцию в виде чугунных болванок, стального прокатного листа и брусков стали. Второе занималось общей металлообработкой, то есть токарным делом, сверлением, прессовкой по штампу и прочими делами, связанными с механической обработкой металла. В третьем управлении сосредоточились работы по термическим и литейным делам. Конечно, второе управление имело свои печи для отпуска заготовок, но ни цементацией, ни закалкой не занималось. Четвёртое управление занималось опытным производством, то есть освоением новых технологий, материалов и механизмов. Помимо всего прочего в этом управлении планировалось разместить центр практических занятий и экспериментальную площадку Боспорской академии. Именно здесь должна была двигаться вперёд металлургия и прикладная физика. Пятое управление было несколько необычно для своего времени. Оно осуществляло контроль качества, приёмку сырья и отгрузку готовой продукции на склады. Здесь же формировались технические задания для рабочих групп и отделов остальных управлений. Ну и в нагрузку это управление следило за состоянием и своевременным ремонтом всех рабочих помещений и механизмов фабрики. Помимо этих пяти управлений была создана так называемая дирекция, в которой помимо директора фабрики, его помощников, секретарей и писарей имелось несколько небольших отделов. Отдел учёта вёл всю статистику по всей деятельности предприятия, включая бухгалтерию, а также выдавал заработную плату. Отдел кадров занимался серьёзной работой среди личного состава фабрики с целью создания личных мотиваций к хорошей работе и отбора тех или иных кандидатов для повышения квалификации в учебном центре при академии. Это было нужно, во-первых, для того, чтобы разнести производство технологически и как следствие этого – сделать реальной территориальную независимость. То есть можно было размещать управления не рядом, а на произвольном удалении друг от друга. Это качество было очень в свете давно назревшего перемещения производства из столицы куда-нибудь подальше, так как мануфактура разрослась и стала угнетающе действовать на горожан шумом и дымом.