Еще одним, малозаметным со стороны, кризисом стал подспудный конфликт в руководстве СССР. Первоначальный триумвират из Берии, Маленкова и Хрущева быстро превратился в дуумвират из Берии и Маленкова. Естественно снижение роли КПСС и лично Хрущева последнему не понравилось и он предпринимал любые меры, чтобы занять прежнее место в триумвирате, а используя опыт Сталина - стать первым. Исподволь он пытался расколоть дуумвират, перетянув на свою сторону Маленкова и запугав всех остальных членов вновь созданного Президиума Политбюро возможностью установления единовластной диктатуры Берии. Маленков, рассчитывавший что Берия, возглавив ГКО, займется чисто военными делами, не учел особенностей военного времени, когда практически любая деятельность прямо или косвенно касалась обороноспособности. Поэтому все больше и больше рычагов власти переходило к ГКО, оттесняя на второй план правительство и соответственно самого Маленкова. Его это раздражало, заставляя больше прислушивался к словам Хрущева и Булганина. Переходу конфликта в прямое противостояние мешала война. Кроме того, военные, до этого настроенные критически к представителю карательных органов, так же как ранее ученые, задействованные в атомном проекте, оценили его организаторские способности. Умелое управление войной, способность опираться на компетентных и инициативных подчиненных, решительность, короче все то, что называется талантом управленца, импонировало военным, прекрасно осознававшим способности остальных вождей.